Unidad III Glucólisis y ciclo de Krebs

Glucólisis

La glucólisis se define oficialmente como “la oxidación de glucosa a piruvato”.  Se lleva a cabo en el citoplasma de las células en un lapso de 10 reacciones

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK22593/figure/A2207/?report=objectonly

En el curso aprenderemos las rutas metabólicas en 3 versiones:

versión 1– saber las rx´s de la ruta (se fosforila, se isomeriza, se corta, etc) conociendo el por qué de cada rx. Sin enzimas

version 2– saber las enzimas de la ruta. Si es kinasa siempre habrá ATP de por medio, si es un rx de isomerización será una isomerasa, pondremos el nombre del sustrato  logicado desde la versión 1  y trataremos de inferir el nombre y la clase de la enzima NUNCA memorices un nombre, logícalo.

versión 3 – Los sustratos, productos, enzimas y energía libre de cada rx para así inferir la rx que controla o regula la ruta

Usaremos el Voet para cubrir el material referente a los mecanismos de rx. En el caso de la glucólisis puedes consultar el Voet directo o el material resumido en scribd

Ahora que sabemos de qué se trata la glucólisis, podemos ver qué pasa con el piruvato que se produce en la sección de “destinos del piruvato”  y comenzaremos a abordar otras rutas metabólicas de la glucosa. Primero veremos la producción de glucógeno (glucogénesis) que se lleva a cabo en hígado y músculos (en el citoplasma) como una forma de almacenamiento de glucosa a corto plazo. Veremos también  la conversión de glucógeno de regreso  a glucosa cuando se acaba la glucosa circulante (glucogenólisis) en un ayuno moderado (2-4 horas después de la ingesta)

presentación ppt de la clase    destinos del piruvato_glucogénesis

Ahora ya puedes practicar estas 2 rutas en KEGG junto con los destinos del piruvato (pyruvate fates). En la próxima clase abordaremos el resto de las rutas metabólicas. Googlea lo mínimo sobre ellas, consulta el Voet y Voet y ubicalas en KEGG con sus enzimas y toda la información que trabajaste para enzimas en la unidad II agregando información sobre Km

mecanismos de control de cada ruta

Es importante resaltar los mecanismos de control de cada ruta. En esta presentación ppt Refuerzo-retroalimentación metabolismo de HC  puedes ver que cada ruta tiene una enzima que regula la ruta ¿cómo se determina cuál es esa enzima? mediante la tabla de energía libre de Gibs, a mayor energía liberada, mas control tiene la rx sobre la ruta, más regulada estará esa enzima. Para conocer la regulación de la ruta hay que conocer la regulación de la enzima y para ello hay que conocer caracteristicas como Km, velocidad de la reacción, afinidad por el sustrat, inhibidores, activadores etc. En esta presentación puedes ver algunos de estosa datos para una o dos rutas y con base en ellos tu puedes ir aprendiendo a generar esta información para cualquier ruta apoyandote en un buen libro 8como el Voet y Voet y en una buena base de datos, como KEGG, EXPASY o BRENDA.

Recuerda:

  • No pases a las actividades de regulación si no dominas la ruta en versión 1, luego en 2 y luego en 3.
  • Es mejor tomarte tu tiempo para comprender la ruta en version 1 que tratar de avanzar dando palos de ciego
  • No te desesperes, la bioquimica es preciosa, pero hay que saber aproximarla, poco a poco irás mejorando

glycolysis-wordle1

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4 respuestas a Unidad III Glucólisis y ciclo de Krebs

  1. Natali Dvz dijo:

    Compañeros aquí tienen el link de mi EPA:
    https://www.facebook.com/thelifeofscience?ref=hl
    Donde podrán encontrar la exposición relacionada al Ciclo de Krebs.

  2. valelupita dijo:

    buenas noches Dra le dejo el link de la exposicion del ciclo de krebs
    link alojamiento en el EPA: http://valeruiz.wordpress.com/2014/09/07/ciclo-de-krebs/
    link descarga directa: https://valeruiz.files.wordpress.com/2014/09/pres_ciclodekrebs.pptx
    equipo
    Coutiño Diana
    Dominguez Zuleima
    Perez Florinda
    Ruiz Valeria

  3. este es el link de nuestra exposición ciclo de krebs equipo Flor,Zuli,Vale y Diana http://bioquimic.weebly.com/ciclo-de-krebs.html

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